基于Python实现nc批量转tif格式


Posted in Python onAugust 14, 2022

由于做项目需要运用到netCDF格式的气象数据,而ArcGIS中需要用栅格影像进行处理,对于较多的文件,ArcGIS一个个手动转换过于繁琐,因此我们采用Python进行转换,当然也可以采用matlab进行转换。

首先需要安装下面几个库:

import os
import netCDF4 as nc
import numpy as np
from osgeo import gdal, osr, ogr
import glob

我们可以在下面网址中寻找对应python安装版本的安装包,下载后,在pycharm控制台中直接安装即可。例如pip install netCDF4-1.5.8-cp39-cp39-

win_amd64.whl

https://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/

安装之后即可进行转换:

def nc2tif(data, Output_folder):
    tmp_data = nc.Dataset(data)  # 利用.Dataset()方法读取nc数据
    print('tmp_data', tmp_data)
 
    Lat_data = tmp_data.variables['lat'][:]
    Lon_data = tmp_data.variables['lon'][:]
    # print(Lat_data)
    # print(Lon_data)
 
    tmp_arr = np.asarray(tmp_data.variables['temp'])
 
    # 影像的左上角&右下角坐标
    Lonmin, Latmax, Lonmax, Latmin = [Lon_data.min(), Lat_data.max(), Lon_data.max(), Lat_data.min()]
    # print(Lonmin, Latmax, Lonmax, Latmin)
 
    # 分辨率计算
    Num_lat = len(Lat_data)  # 5146
    Num_lon = len(Lon_data)  # 7849
    Lat_res = (Latmax - Latmin) / (float(Num_lat) - 1)
    Lon_res = (Lonmax - Lonmin) / (float(Num_lon) - 1)
    # print(Num_lat, Num_lon)
    # print(Lat_res, Lon_res)
 
    for i in range(len(tmp_arr[:])):
        # i=0,1,2,3,4,5,6,7,8,9,...
        # 创建tif文件
        driver = gdal.GetDriverByName('GTiff')
        out_tif_name = Output_folder + '\\' + data.split('\\')[-1].split('.')[0] + '_' + str(i + 1) + '.tif'
        out_tif = driver.Create(out_tif_name, Num_lon, Num_lat, 1, gdal.GDT_Int16)
 
        # 设置影像的显示范围
        # Lat_re前需要添加负号
        geotransform = (Lonmin, Lon_res, 0.0, Latmax, 0.0, -Lat_res)
        out_tif.SetGeoTransform(geotransform)
 
        # 定义投影
        prj = osr.SpatialReference()
        prj.ImportFromEPSG(4326)  # WGS84
        out_tif.SetProjection(prj.ExportToWkt())
 
        # 数据导出
        out_tif.GetRasterBand(1).WriteArray(tmp_arr[i])  # 将数据写入内存,此时没有写入到硬盘
        out_tif.FlushCache()  # 将数据写入到硬盘
        out_tif = None  # 关闭tif文件
 
def main():
    Input_folder = r"E:\competition\航天宏图\2-meter air temperature_CMFD\Data_forcing_01yr_010deg\\"
    # Input_folder = r"E:\competition\航天宏图\2-meter air temperature_CMFD\Data_forcing_01mo_010deg\\"
    Output_folder = r"E:\competition\航天宏图\2-meter air temperature_CMFD\tif\\"
 
    # 读取所有数据
    data_list = glob.glob(os.path.join(Input_folder + '*.nc'))
    print(data_list)
 
    for i in range(len(data_list)):
        data = data_list[i]
        nc2tif(data, Output_folder)
        print(data + '转tif成功')

值得注意的是,tmp_arr = np.asarray(tmp_data.variables['temp'])中的temp可以根据需要转换的波段进行选择,我们可以在读取数据之后print一下,找到对应的波段进行替换即可。如下图中我们应该选择的就是temp。

基于Python实现nc批量转tif格式

完成上述步骤即可得到所需的tif图像:

基于Python实现nc批量转tif格式

基于Python实现nc批量转tif格式

在上述代码中,经过处理的影像是倒置的,可能是处理过程中仿射矩阵读写错误导致的。因此我们可以在写入影像的时候,进行影像的垂直镜像操作即可:WriteArray(ndvi_arr_float[i][::-1]) 

def NC_to_tiffs(data, Output_folder):
    nc_data_obj = nc.Dataset(data)
    Lon = nc_data_obj.variables['lon'][:]
    Lat = nc_data_obj.variables['lat'][:]
    ndvi_arr = np.asarray(nc_data_obj.variables['temp'])  
    ndvi_arr_float = ndvi_arr.astype(float) / 10000  之间
    # 影像的左上角和右下角坐标
    LonMin, LatMax, LonMax, LatMin = [Lon.min(), Lat.max(), Lon.max(), Lat.min()]
    # 分辨率计算
    N_Lat = len(Lat)
    N_Lon = len(Lon)
    Lon_Res = (LonMax - LonMin) / (float(N_Lon) - 1)
    Lat_Res = (LatMax - LatMin) / (float(N_Lat) - 1)
    for i in range(len(ndvi_arr[:])):
        driver = gdal.GetDriverByName('GTiff')
        out_tif_name = Output_folder + '\\' + data.split('\\')[-1].split('.')[0] + '_' + str(i + 1) + '.tif'
        out_tif = driver.Create(out_tif_name, N_Lon, N_Lat, 1, gdal.GDT_Float32)
       
        geotransform = (LonMin, Lon_Res, 0, LatMax, 0, -Lat_Res)
        out_tif.SetGeoTransform(geotransform)
      
        srs = osr.SpatialReference()
        srs.ImportFromEPSG(4326) 
        out_tif.SetProjection(srs.ExportToWkt()) 
        # 数据写出
        out_tif.GetRasterBand(1).WriteArray(ndvi_arr_float[i][::-1])  # 将数据写入内存,此时没有写入硬盘 此处[::-1]用于图像的垂直镜像对称,避免图像颠倒
        out_tif.FlushCache()  # 将数据写入硬盘
        out_tif = None  # 注意必须关闭tif文件

这样便可以得到正确输出的影像:

基于Python实现nc批量转tif格式

当然,我们除了在写入时做垂直镜像操作之外,还可以利用python对图像进行几何变换来实现翻转。具体代码如下:

图像水平翻转:

#  图像水平翻转
    im_data_hor = np.flip(im_data, axis=2)
    hor_path = train_image_path + "\\" + str(tran_num) + imageList[i][-4:]
    writeTiff(im_data_hor, im_geotrans, im_proj, hor_path)

标签水平翻转: 

#  标签水平翻转
    Hor = cv2.flip(label, 1)
    hor_path = train_label_path + "\\" + str(tran_num) + labelList[i][-4:]
    cv2.imwrite(hor_path, Hor)
    tran_num += 1

图像垂直翻转:

#  图像垂直翻转
    im_data_vec = np.flip(im_data, axis=1)
    vec_path = train_image_path + "\\" + str(tran_num) + imageList[i][-4:]
    writeTiff(im_data_vec, im_geotrans, im_proj, vec_path)

标签垂直翻转:

#  标签垂直翻转
    Vec = cv2.flip(label, 0)
    vec_path = train_label_path + "\\" + str(tran_num) + labelList[i][-4:]
    cv2.imwrite(vec_path, Vec)
    tran_num += 1

图像镜像翻转:

#  图像对角镜像
    im_data_dia = np.flip(im_data_vec, axis=2)
    dia_path = train_image_path + "\\" + str(tran_num) + imageList[i][-4:]
    writeTiff(im_data_dia, im_geotrans, im_proj, dia_path)

标签镜像翻转:

#  标签对角镜像
    Dia = cv2.flip(label, -1)
    dia_path = train_label_path + "\\" + str(tran_num) + labelList[i][-4:]
    cv2.imwrite(dia_path, Dia)
    tran_num += 1

若是输出路径的文件夹没有建立好,则会报如下错误。当然,为了减少工作量,也可以定义一个函数,如果路径不存在则自动创建,就可以解决这个问题。

基于Python实现nc批量转tif格式

到此这篇关于基于Python实现nc批量转tif格式的文章就介绍到这了,更多相关Python nc转tif内容请搜索三水点靠木以前的文章或继续浏览下面的相关文章希望大家以后多多支持三水点靠木!

Python 相关文章推荐
Python3 入门教程 简单但比较不错
Nov 29 Python
分析并输出Python代码依赖的库的实现代码
Aug 09 Python
python3+PyQt5使用数据库窗口视图
Apr 24 Python
python numpy数组的索引和切片的操作方法
Oct 20 Python
Django外键(ForeignKey)操作以及related_name的作用详解
Jul 29 Python
100行Python代码实现每天不同时间段定时给女友发消息
Sep 27 Python
python超时重新请求解决方案
Oct 21 Python
Python 安装 virturalenv 虚拟环境的教程详解
Feb 21 Python
django使用JWT保存用户登录信息
Apr 22 Python
python 实现逻辑回归
Dec 30 Python
详解Python 3.10 中的新功能和变化
Apr 28 Python
宝塔更新Python及Flask项目的部署
Apr 11 Python
LyScript实现绕过反调试保护的示例详解
Aug 14 #Python
LeetCode189轮转数组python示例
Aug 05 #Python
python语言中pandas字符串分割str.split()函数
Aug 05 #Python
python绘制云雨图raincloud plot
Aug 05 #Python
python计算列表元素与乘积详情
Aug 05 #Python
Pygame游戏开发之太空射击实战敌人精灵篇
Aug 05 #Python
python playwrigh框架入门安装使用
Jul 23 #Python
You might like
新版mysql+apache+php Linux安装指南
2006/10/09 PHP
PHP 5.0对象模型深度探索之对象复制
2008/03/27 PHP
PHP程序员常见的40个陋习,你中了几个?
2014/11/20 PHP
Yii框架在页面输出执行sql语句以方便调试的实现方法
2014/12/24 PHP
PHP使用trim函数去除字符串左右空格及特殊字符实例
2016/01/07 PHP
php实现将HTML页面转换成word并且保存的方法
2016/10/14 PHP
PHP数组中头部和尾部添加元素的方法(array_unshift,array_push)
2017/04/10 PHP
PHP实现登陆并抓取微信列表中最新一组微信消息的方法
2017/07/10 PHP
In Javascript Class, how to call the prototype method.(three method)
2007/01/09 Javascript
JQery jstree 大数据量问题解决方法
2010/03/09 Javascript
基于jQuery的input输入框下拉提示层(自动邮箱后缀名)
2012/06/14 Javascript
JS 毫秒转时间示例代码
2013/09/22 Javascript
常用的JavaScript WEB操作方法分享
2015/02/28 Javascript
jQuery实现表单动态加减、ajax表单提交功能
2018/06/08 jQuery
Vue实现导航栏点击当前标签变色功能
2020/08/19 Javascript
JavaScript内置对象math,global功能与用法实例分析
2019/06/10 Javascript
layer扩展打开/关闭动画的方法
2019/09/23 Javascript
JavaScript实现Tab标签页切换的最简便方式(4种)
2020/06/28 Javascript
JavaScript实现消消乐的源代码
2021/01/12 Javascript
Python中尝试多线程编程的一个简明例子
2015/04/07 Python
Python中的FTP通信模块ftplib的用法整理
2016/07/08 Python
TensorFlow损失函数专题详解
2018/04/26 Python
如何让PyQt5中QWebEngineView与JavaScript交互
2020/10/21 Python
Python创建简单的神经网络实例讲解
2021/01/04 Python
Pytorch - TORCH.NN.INIT 参数初始化的操作
2021/02/27 Python
手摸手教你用canvas实现给图片添加平铺水印的实现
2019/08/20 HTML / CSS
Clearly新西兰:购买眼镜、太阳镜和隐形眼镜
2018/04/26 全球购物
周仰杰(JIMMY CHOO)英国官方网站:闻名世界的鞋子品牌
2018/10/28 全球购物
在线实验室测试:HealthLabs.com
2020/05/03 全球购物
美术教师岗位职责
2014/03/18 职场文书
小学学习雷锋活动总结
2014/07/03 职场文书
工作散漫检讨书
2014/09/16 职场文书
大三学年自我鉴定范文(3篇)
2014/09/28 职场文书
党的群众路线教育实践活动心得体会(医院)
2014/11/03 职场文书
2014年妇幼保健工作总结
2014/12/08 职场文书
小学英语教师2015年度个人工作总结
2015/10/14 职场文书