完美解决TensorFlow和Keras大数据量内存溢出的问题


Posted in Python onJuly 03, 2020

内存溢出问题是参加kaggle比赛或者做大数据量实验的第一个拦路虎。

以前做的练手小项目导致新手产生一个惯性思维——读取训练集图片的时候把所有图读到内存中,然后分批训练。

其实这是有问题的,很容易导致OOM。现在内存一般16G,而训练集图片通常是上万张,而且RGB图,还很大,VGG16的图片一般是224x224x3,上万张图片,16G内存根本不够用。这时候又会想起——设置batch,但是那个batch的输入参数却又是图片,它只是把传进去的图片分批送到显卡,而我OOM的地方恰是那个“传进去”的图片,怎么办?

解决思路其实说来也简单,打破思维定式就好了,不是把所有图片读到内存中,而是只把所有图片的路径一次性读到内存中。

大致的解决思路为:

将上万张图片的路径一次性读到内存中,自己实现一个分批读取函数,在该函数中根据自己的内存情况设置读取图片,只把这一批图片读入内存中,然后交给模型,模型再对这一批图片进行分批训练,因为内存一般大于等于显存,所以内存的批次大小和显存的批次大小通常不相同。

下面代码分别介绍Tensorflow和Keras分批将数据读到内存中的关键函数。Tensorflow对初学者不太友好,所以我个人现阶段更习惯用它的高层API Keras来做相关项目,下面的TF实现是之前不会用Keras分批读时候参考的一些列资料,在模型训练上仍使用Keras,只有分批读取用了TF的API。

Tensorlow

在input.py里写get_batch函数。

def get_batch(X_train, y_train, img_w, img_h, color_type, batch_size, capacity):
  '''
  Args:
    X_train: train img path list
    y_train: train labels list
    img_w: image width
    img_h: image height
    batch_size: batch size
    capacity: the maximum elements in queue
  Returns:
    X_train_batch: 4D tensor [batch_size, width, height, chanel],\
            dtype=tf.float32
    y_train_batch: 1D tensor [batch_size], dtype=int32
  '''
  X_train = tf.cast(X_train, tf.string)

  y_train = tf.cast(y_train, tf.int32)
  
  # make an input queue
  input_queue = tf.train.slice_input_producer([X_train, y_train])

  y_train = input_queue[1]
  X_train_contents = tf.read_file(input_queue[0])
  X_train = tf.image.decode_jpeg(X_train_contents, channels=color_type)

  X_train = tf.image.resize_images(X_train, [img_h, img_w], 
                   tf.image.ResizeMethod.NEAREST_NEIGHBOR)

  X_train_batch, y_train_batch = tf.train.batch([X_train, y_train],
                         batch_size=batch_size,
                         num_threads=64,
                         capacity=capacity)
  y_train_batch = tf.one_hot(y_train_batch, 10)

  return X_train_batch, y_train_batch

在train.py文件中训练(下面不是纯TF代码,model.fit是Keras的拟合,用纯TF的替换就好了)。

X_train_batch, y_train_batch = inp.get_batch(X_train, y_train, 
                       img_w, img_h, color_type, 
                       train_batch_size, capacity)
X_valid_batch, y_valid_batch = inp.get_batch(X_valid, y_valid, 
                       img_w, img_h, color_type, 
                       valid_batch_size, capacity)
with tf.Session() as sess:

  coord = tf.train.Coordinator()
  threads = tf.train.start_queue_runners(coord=coord)
  try:
    for step in np.arange(max_step):
      if coord.should_stop() :
        break
      X_train, y_train = sess.run([X_train_batch, 
                       y_train_batch])
      X_valid, y_valid = sess.run([X_valid_batch,
                       y_valid_batch])
       
      ckpt_path = 'log/weights-{val_loss:.4f}.hdf5'
      ckpt = tf.keras.callbacks.ModelCheckpoint(ckpt_path, 
                           monitor='val_loss', 
                           verbose=1, 
                           save_best_only=True, 
                           mode='min')
      model.fit(X_train, y_train, batch_size=64, 
             epochs=50, verbose=1,
             validation_data=(X_valid, y_valid),
             callbacks=[ckpt])
      
      del X_train, y_train, X_valid, y_valid

  except tf.errors.OutOfRangeError:
    print('done!')
  finally:
    coord.request_stop()
  coord.join(threads)
  sess.close()

Keras

keras文档中对fit、predict、evaluate这些函数都有一个generator,这个generator就是解决分批问题的。

关键函数:fit_generator

# 读取图片函数
def get_im_cv2(paths, img_rows, img_cols, color_type=1, normalize=True):
  '''
  参数:
    paths:要读取的图片路径列表
    img_rows:图片行
    img_cols:图片列
    color_type:图片颜色通道
  返回: 
    imgs: 图片数组
  '''
  # Load as grayscale
  imgs = []
  for path in paths:
    if color_type == 1:
      img = cv2.imread(path, 0)
    elif color_type == 3:
      img = cv2.imread(path)
    # Reduce size
    resized = cv2.resize(img, (img_cols, img_rows))
    if normalize:
      resized = resized.astype('float32')
      resized /= 127.5
      resized -= 1. 
    
    imgs.append(resized)
    
  return np.array(imgs).reshape(len(paths), img_rows, img_cols, color_type)

获取批次函数,其实就是一个generator

def get_train_batch(X_train, y_train, batch_size, img_w, img_h, color_type, is_argumentation):
  '''
  参数:
    X_train:所有图片路径列表
    y_train: 所有图片对应的标签列表
    batch_size:批次
    img_w:图片宽
    img_h:图片高
    color_type:图片类型
    is_argumentation:是否需要数据增强
  返回: 
    一个generator,x: 获取的批次图片 y: 获取的图片对应的标签
  '''
  while 1:
    for i in range(0, len(X_train), batch_size):
      x = get_im_cv2(X_train[i:i+batch_size], img_w, img_h, color_type)
      y = y_train[i:i+batch_size]
      if is_argumentation:
        # 数据增强
        x, y = img_augmentation(x, y)
      # 最重要的就是这个yield,它代表返回,返回以后循环还是会继续,然后再返回。就比如有一个机器一直在作累加运算,但是会把每次累加中间结果告诉你一样,直到把所有数加完
      yield({'input': x}, {'output': y})

训练函数

result = model.fit_generator(generator=get_train_batch(X_train, y_train, train_batch_size, img_w, img_h, color_type, True), 
     steps_per_epoch=1351, 
     epochs=50, verbose=1,
     validation_data=get_train_batch(X_valid, y_valid, valid_batch_size,img_w, img_h, color_type, False),
     validation_steps=52,
     callbacks=[ckpt, early_stop],
     max_queue_size=capacity,
     workers=1)

就是这么简单。但是当初从0到1的过程很难熬,每天都没有进展,没有头绪,急躁占据了思维的大部,熬过了这个阶段,就会一切顺利,不是运气,而是踩过的从0到1的每个脚印累积的灵感的爆发,从0到1的脚印越多,后面的路越顺利。

以上这篇完美解决TensorFlow和Keras大数据量内存溢出的问题就是小编分享给大家的全部内容了,希望能给大家一个参考,也希望大家多多支持三水点靠木。

Python 相关文章推荐
Python中实现的RC4算法
Feb 14 Python
python smtplib模块发送SSL/TLS安全邮件实例
Apr 08 Python
python中logging库的使用总结
Oct 18 Python
python版DDOS攻击脚本
Jun 12 Python
python的pstuil模块使用方法总结
Jul 26 Python
Jupyter notebook 启动闪退问题的解决
Apr 13 Python
Python 使用双重循环打印图形菱形操作
Aug 09 Python
GitHub上值得推荐的8个python 项目
Oct 30 Python
基于python爬取梨视频实现过程解析
Nov 09 Python
Python中22个万用公式的小结
Jul 21 Python
Python 视频画质增强
Apr 28 Python
pandas时间序列之pd.to_datetime()的实现
Jun 16 Python
Keras 在fit_generator训练方式中加入图像random_crop操作
Jul 03 #Python
keras的三种模型实现与区别说明
Jul 03 #Python
Keras中 ImageDataGenerator函数的参数用法
Jul 03 #Python
python程序如何进行保存
Jul 03 #Python
keras的ImageDataGenerator和flow()的用法说明
Jul 03 #Python
python如何安装下载后的模块
Jul 03 #Python
python中id函数运行方式
Jul 03 #Python
You might like
Thinkphp模板中使用自定义函数的方法
2012/09/23 PHP
PHP编码转换
2012/11/05 PHP
一个完整的php文件上传类实例讲解
2015/10/27 PHP
Laravel5.4简单实现app接口Api Token认证方法
2019/08/29 PHP
PHP语言对接抖音快手小红书视频/图片去水印API接口源码
2020/08/11 PHP
锋利的jQuery 要点归纳(二) jQuery中的DOM操作(下)
2010/03/23 Javascript
JavaScript 设计模式 安全沙箱模式
2010/09/24 Javascript
简单实用的全选反选按钮例子
2013/10/18 Javascript
单元选择合并变色示例代码
2014/05/26 Javascript
CSS3实现动态背景登录框的代码
2015/07/28 Javascript
基于jQuery+PHP+Mysql实现在线拍照和在线浏览照片
2015/09/06 Javascript
jQuery实现鼠标经过时出现隐藏层文字链接的方法
2015/10/12 Javascript
利用jsonp跨域调用百度js实现搜索框智能提示
2016/08/24 Javascript
JS基于正则截取替换特定字符之间字符串操作示例
2017/02/03 Javascript
vue.js 获取当前自定义属性值
2017/06/01 Javascript
jQuery实现图片简单轮播功能示例
2018/08/13 jQuery
JS三级联动代码格式实例详解
2019/12/30 Javascript
在漏洞利用Python代码真的很爽
2007/08/26 Python
详解js文件通过python访问数据库方法
2019/03/03 Python
python利用多种方式来统计词频(单词个数)
2019/05/27 Python
使用pyecharts1.7进行简单的可视化大全
2020/05/17 Python
【HTML5】3D模型--百行代码实现旋转立体魔方实例
2016/12/16 HTML / CSS
意大利奢侈品零售商:ilDuomo Novara
2019/09/11 全球购物
德国旅行、体验和活动的预订平台:Watado
2019/12/04 全球购物
土耳其新趋势女装购物网站:Addax
2020/01/07 全球购物
纪检干部先进事迹材料
2014/08/23 职场文书
纪念九一八事变演讲稿:勿忘国耻
2014/09/14 职场文书
依法行政工作汇报材料
2014/10/28 职场文书
旷课检讨书范文
2014/10/30 职场文书
放假通知
2015/04/14 职场文书
城镇居民医疗保险工作总结
2015/08/10 职场文书
组织委员竞选稿
2015/11/21 职场文书
幼儿园大班开学寄语(2016秋季)
2015/12/03 职场文书
关于企业的执行力标语大全
2020/01/06 职场文书
Python爬虫:从m3u8文件里提取小视频的正确操作
2021/05/14 Python
Python基础 括号()[]{}的详解
2021/11/07 Python